S2 E1 • Nouveau départ

Alors que Jeffrey Sinclair a été réassigné et est devenu le premier ambassadeur humain sur Minbar, Babylon 5 accueille son nouveau commandant: le capitaine John Sheridan. Si le gouvernement terrien voit d'un très bon oeil son arrivée aux commandes, il en est tout autrement pour les Minbaris: pour eux, Sheridan est le "tueur d'étoiles", le seul humain qui ait réussi à détruire un de leurs croiseurs durant la guerre. La première crise qu'il a à résoudre va d'ailleurs l'opposer à un croiseur minbari rebel: le Tragati. Son commandant, Kalain, n'a jamais accepté que les Minbaris aient signé la reddition face aux humains...

S2 E2 • Révélations

Elisabeth, la jeune soeur du Commandant Sheridan, arrive à bord de la station. Elle vient rendre visite à son frère afin de le persuader d'accepter la mort de sa femme Anna et de le convaincre de recommencer à vivre. Quelques temps après, l'ambassadeur G'Kar est de retour sur Babylon 5: il revient avec un avertissement: une ancienne et sombre race s'est éveillée et menace toute la galaxie. Mais personne ne semble alors prendre l'ambassadeur au sérieux...Le docteur Franklin décide d'utiliser la machine alien qui permet de transférer de l'énergie d'un individu vers un autre, afin de sauver Garibaldi qui est toujours dans le coma...L'ambassadeur Delenn sort enfin de sa chrysalide: sa nouvelle apparence va surprendre les habitants de Babylon 5...

S2 E3 • La géométrie des Ombres

L'ambassadeur Mollari s'associe avec Lord Refa, un centauri haut placé qui intrigue en vue de prendre le pouvoir dès que l'Empereur Turhan sera mort. La station reçoit la visite de technomages . Lorsque Londo l'apprend, il devient obsédé par l'idée d'obtenir une entrevue auprès d'eux...Ivanova est promue au rang de commandant et est chargée par Sheridan de régler différents conflits diplomatiques sur la station: sa première mission sera de jouer les arbîtres entre deux groupes de Drazis, les verts et les violets...

S2 E4 • Une étoile éloignée

Le capitaine Jack Maynard, sous les ordres de qui Sheridan a servi autrefois, arrive sur Babylon 5 afin de ravitailler son vaisseau d'exploration le Cortez. Maynard est étonné par tout ce qu'il voit sur la station mais il affirmera pourtant à Sheridan que ce qu'il a observé ces derniers temps dans les limbes est bien plus étrange et inquiétant encore...Quelques temps après, alors que le vaisseau est reparti pour les limbes, il subit une explosion et se met à errer au hasard dans l'hyperespace. Le Cortez n'a alors plus qu'un seul espoir: que Babylon 5 reçoive son message de détresse et vienne à son secours...Depuis sa transformation, Delenn semble mal acceptée par les siens. Tous se demandent si elle est encore une minbari...Le docteur Franklin, qui trouve que l'équipage se nourrit mal, a préparé un plan de régime alimentaire pour Ivanova, Garibaldi et Sheridan.

S2 E5 • L'ennemi du passé

Le Copernicus, un vaisseau envoyé en mission par la Terre il y a plus de cent ans, échoue sur Babylon 5. A bord, les deux humains de l'équipage sont en hibernation dans une suspension cryogénique: mais alors que la femme, Maria, est toujours vivante, son compagnon Will est mort durant le voyage. Maria devient alors la principale suspecte. Mais après être sortie de son état d'hibernation, la jeune femme affirme qu'elle n'y est pour rien. Elle est par contre hantée par d'horribles cauchemars et est persuadée qu'un monstre, un serviteur des forces du mal, était à bord du Copernicus et qu'il est donc sur la station à présent...

S2 E6 • L'espion

Taro Isogi, responsable de la société FutureCorp, rencontre Amanda Carter du Conglomérat Martien sur Babylon 5: leur but est de trouver une solution pacifique à la crise martienne. Très peu de temps après cela, Isogi est assassiné par un fanatique indépendantiste martien. Le meurtrier réalise alors qu'un témoin a vu toute la scène: il s'agit de la télépathe Talia Winters. Au moment où l'assassin va pour la tuer à son tour, Talia scanne son esprit; mais elle n'y voit qu'une seule scène sans arrêt répétée: la mort de l'homme en question. Celui-ci apparait alors complètement désorienté et terrorisé, et il s'enfuit, laissant Talia en vie. Peu de temps après, le meurtrier est identifié comme étant Abel Horn, un indépendantiste martien mort en 2258 lors de la rebellion sur Mars!...

S2 E7 • Compagnons d'âme

L'ambassadeur Mollari est fou de joie quand l'Empereur Turhan lui donne la permission de divorcer de deux de ses trois femmes: Mariel, Daggair et Timov. Alors que les trois sont venues le rejoindre sur Babylon 5, un seul problème se pose à lui: laquelle garder!...Talia Winters a la surprise de voir arriver son ex-mari Matthew Stoner sur la station: celui-ci prétend avoir quitté le Corps Psi après avoir perdu ses pouvoirs...L'ambassadeur Delenn a quelques problèmes avec sa nouvelle apparence: elle demande l'aide de Susan Ivanova...

S2 E8 • Les télépathes de l'ombre

Le policier du Corps Psi, Bester, arrive sur Babylon 5: il vient enquêter sur la possible existence d'un réseau clandestin de télépathes qui se cacheraient sur la station. Quand des membres de ce groupe de télépathes tentent de l'assassiner, ils échouent mais réussissent à kidnapper Talia Winters...Le docteur Franklin avoue au Commandant Sheridan qu'il connaissait l'existence du groupe rebel de télépathes et qu'il les a déjà aidés auparavant. Sheridan et Ivanova sont furieux lorsqu'ils apprennent que l'Alliance Terrienne a augmenté leurs loyers et qu'ils devront déménager s'ils ne paient pas...Delenn demande un rendez-vous à Sheridan afin qu'ils aillent dîner au restaurant...

S2 E9 • La venue des Ombres

L'Empereur Centauri Turhan se rend en visite officielle sur Babylon 5. L'ambassadeur G'Kar voit là l'occasion de venger son peuple et il se prépare à assassiner l'Empereur. Mais il n'en n'aura pas le temps: Turhan fait une attaque cardiaque et se retrouve au Medlab. L'Empereur envoie alors Franklin délivrer un message à l'ambassadeur Narn: il est désolé pour ce que les Centauris ont fait subir aux Narns et il souhaite réparer les choses .Mais alors que l'Empereur cherche à faire la paix, d'autres Centauris, aveuglés par leur ambition et leur arrogance, vont précipiter la guerre: Mollari, sous la pression de Lord Refa, demande une fois de plus l'aide des associés de Mr Morden afin de conquérir le Quadrant 14, sous contrôle narn...Garibaldi reçoit un étrange message de Sinclair, à présent ambassadeur sur Minbar: Jeffrey lui annonce que les ténèbres sont de retour mais que les Rangers sont là pour les stopper...

S2 E10 • Les troufions

Babylon 5 est envahie par 25 000 soldats de l'Alliance Terrienne sous le commandement du général Richard Franklin, le père du docteur Stephen Franklin. Ces soldats doivent participer à une mission secrète sur Akdor...Lorsque Stephen et son père Richard se retrouvent face à face, la discussion ne met pas longtemps à mal tourner...

S2 E11 • Seul dans la nuit

Alors que le Commandant Sheridan se trouve dans l'espace, il est attaqué et kidnappé par un vaisseau alien non identifié. Une fois à bord, les aliens effectuent sur lui certaines expérimentations et il est torturé. Il rencontre alors un Narn, Ta'Lon, qui se trouve dans la même position que lui...Delenn de son côté doit faire face au Conseil Gris qui refuse de la considérer encore comme l'une des leurs. Lorsque Delenn apprend que Sheridan a été kidnappé, elle décide de partir à son secours. Sheridan a une longue conversation avec le général Hague: celui-ci lui révèle que l'assassinat de l'ancien président Santiago fait partie d'une gigantesque conspiration menée par le gouvernement terrien...

S2 E12 • Sacrifices

La tension entre les Narns et les Centauris est devenue ingérable sur la station depuis que les deux races sont en guerre. L'ambassadeur G'Kar cherche désespérément une aide militaire pour son peuple, écrasé sous les attaques centauries. Sheridan promet de trouver une solution pour l'aider...Ivanova est chargée de convaincre le nouvel ambassadeur Lumati de l'intérêt du projet Babylon, afin que son peuple rejoigne toutes les autres races extraterrestres qui y participent déjà...

S2 E13 • La traque

L'agent spécial des forces terriennes, Derek Cranston, arrive sur Babylon 5 pour organiser la poursuite du Dr Everett Jacobs, qui est accusé d'avoir mis en danger la sécurité de la Terre. Mais Sarah, l'associée du général Hague, révèle à Sheridan que la seule faute commise par Jacobs est de posséder un cristal de données contenant la preuve que le nouveau président Clark a joué un rôle dans l'assassinat de Santiago...L'équipage va alors devoir trouver un moyen de sauver Jacobs des griffes des hommes de l'Alliance Terrienne. Sheridan se rapproche un peu plus de l'ambassadeur Vorlon Kosh au cours de cette aventure.

S2 E14 • Mentir pour l'honneur

Lors d'une altercation avec un minbari, Lovell, de la caste guerrière, le Commandant Sheridan tue ce dernier en état de légitime défense. Mais le capitaine se retrouve dans une mauvaise posture lorsque le seul témoin, Ashan, un autre minbari, va affirmer qu'il a tué Lovell de sang froid. Lennier décide alors de mener l'enquête afin de découvrir la vérité...Un magasin de souvenirs, l'Emporium, ouvre ses portes sur la station. Si au départ Sheridan y est plutôt favorable, l'un des articles vendus par l'Emporium va le faire changer d'avis...

S2 E15 • Reportage

Babylon 5 est le sujet d'un documentaire de la chaine ISN: "36 heures à bord de Babylon 5". La journaliste, Cynthia Torqueman, a interviewé l'équipage ainsi que les différents ambassadeurs de la station...

S2 E16 • Dans l'ombre de Z'ha'dum

Alors que le Commandant Sheridan est en train de revisionner des photos de l'équipage de l'Icarus, que sa femme Anna lui avait envoyées avant la destruction du vaisseau, Garibaldi reconnait un des membres de l'équipage, censé être mort en même temps qu'Anna, comme étant Mr Morden. Sheridan ordonne alors l'arrestation de ce dernier et décide de passer outre toutes les réglementations afin de l'interroger. La désapprobation de Garibaldi et les plaintes du gouvernement Centauri n'y changeront rien. Mais Delenn et l'ambassadeur Kosh vont le convaincre de stopper son interrogatoire car cela les met tous en grand danger...Pierce Macabee, du Ministère de la Paix, vient présenter certains programmmes organisés par son ministère dont, entre autres, la Garde de Nuit, dans le but de recruter certains membres de l'équipage...

S2 E17 • Le duel

Londo Mollari retrouve un vieil ami, Urza Jaddo: celui-ci lui explique qu'il a été accusé de trahison et lui demande son aide afin de protéger l'honneur de sa famille. Mais lorsque Londo apprend que Lord Refa est à l'origine de l'accusation de trahison, il comprend qu'il ne pourra pas l'aider...De son côté, le capitaine Sheridan décide d'aller inspecter le Secteur Gris de Babylon 5, connu pour les étranges phénomènes qui s'y passent: il est alors attaqué par le cadavre d'un Markab!...

S2 E18 • Le châtiment divin

Les Markabs sont victimes d'une maladie mortelle et extrêmement contagieuse: Drafa. L'épidémie progresse d'autant plus vite qu'aucun des Markabs ne pense être concerné: pour eux, Drafa est un fléau envoyé par Dieu qui ne touche que ceux qui manquent de moralité. Le docteur Franklin va tenter avec l'aide de son ami Markab, le docteur Lazarenn, de trouver un remède. Mais un autre problème va bientôt se poser: la maladie pourrait se propager aux autres races! Les Markabs sont alors mis en quarantaine. Delenn, accompagnée de Lennier, décide malgré les risques de rester avec eux afin de soulager autant que possible leurs souffrances: Sheridan ne pourra alors pas cacher son inquiétude et tentera dans un premier temps de la dissuader de faire une telle folie...

S2 E19 • Examens de confiance

Lyta Alexander, la première télépathe commerciale de la station, revient sur Babylon 5 afin d'avertir l'équipage qu'une des personnes travaillant avec eux est en fait un espion potentiel du Corps Psi. Mais pour l'instant, elle ignore encore de qui il s'agit. Lyta leur explique que cette personne, manipulée par le Corps, possède en fait une deuxième personnalité, que le Corps a créée, et qui n'apparaitra que lorsque Lyta enverra télépathiquement un certain mot de passe: la personnalité d'origine de la personne sera alors totalement détruite et l'individu deviendra un espion entièrement dévoué au Corps Psi. Malgré quelques réticences, Sheridan accepte que Lyta scanne tout l'équipage afin de trouver l'espion...Susan Ivanova et Talia Winters se rapprochent encore un peu plus l'une de l'autre...

S2 E20 • L'armée de lumière

Les Narns qui sont sur le point de perdre la guerre, décide de tenter une dernière action désespérée: ils vont attaquer les Centauris avec tous leurs vaisseaux encore disponibles, tout en sachant que cela va laisser Narn, leur planète, sans défense pendant ce temps. Malheureusement, les Centauris vont apprendre leurs intentions: ils demandent une fois de plus l'aide des associés de Mr Morden, qui vont s'occuper des croiseurs Narns pendant que les vaisseaux centauris vont aller bombarder la planète mère de G'Kar. Les Narns n'ont alors plus d'autres choix que de se rendre et G'Kar est contraint de demander asile sur Babylon 5...Draal, qui contrôle à présent la Grande Machine d'Epsilon 3, prend contact avec John Sheridan: il a une proposition à lui faire...

S2 E21 • L'inquisiteur

G'Kar commence à organiser un mouvement de résistance depuis Babylon 5, dans l'espoir de délivrer sa planète du joug des Centauris. Dans ce but, il achète des armes à tous ceux qui acceptent de lui en vendre, et avec l'aide de Garibaldi, il les fait parvenir sur sa planète. Mais les autres Narns de Babylon 5 hésitent encore à le suivre: ils informent G'Kar qu'ils ne le feront que s'il parvient à leur communiquer des nouvelles de leurs familles sur Narn...L'ambassadeur Kosh a fait venir un inquisiteur afin de tester Delenn, en prévision de la Grande Guerre qui approche. Cette inquisiteur, Sébastian, va torturer et humilier Delenn jusqu'à ce que Sheridan vienne à son secours: ce sera alors au tour de John d'affronter ses questions et au tour de Delenn de le sauver...

S2 E22 • Crépuscule

Après leur victoire contre les Narns, les Centauris continuent à étendre leur Empire: ils envahissent différents territoires Drazis et Pak'ma'ras. Le Commandant Sheridan est furieux de tout ce qui se passe et apprend avec soulagement que la Terre a envoyé sur Babylon 5 Frederick Lantz, du Ministère de la Paix: Sheridan est persuadé que Lantz vient dans le but de trouver un moyen de stopper les Centauris, mais en réalité, il vient pour signer un traité de non-agression avec eux! Pendant le même temps, un croiseur narn en mauvais état arrive dans le secteur de Babylon 5 et demande sa protection: Sheridan accepte de les aider secrètement. Mais Mr Welles de la Garde de Nuit, qui accompagne Lantz, l'apprend et en informe les Centauris: ceux-ci envoient alors un de leurs vaisseaux et somment Babylon 5 de leur livrer le croiseur narn. Sheridan les avertit alors qu'il fera tout ce qui est nécéssaire pour que le croiseur narn reparte sain et sauf, y compris attaquer le vaisseau centauri...Le lieutenant Keffer va faire une terrible rencontre dans l'hyperespace et le payer de sa vie...Un peu plus tard, alors que Sheridan se rend au jardin zen, il est la cible d'un attentat dans le tube de transport (monorail): il se précipite alors dans le vide afin d'échapper à l'explosion de la bombe. Depuis le sol, l'équipage et les ambassadeurs ont vu ce qui se passait: Delenn demande à Kosh d'agir, afin de sauver John d'une mort certaine...