S6 E1 • Le temple de Morphée

Des années auparavant, Jafar parvient à retrouver Aladdin, caché dans une maison au milieu du désert assailli de tremblements. Alors qu'Aladdin demande à son ennemi sorcier de le tuer, Jafar préfère laisser celui qu'il voit comme le Sauveur à son sort et savourer la déchéance de son ennemi.

S6 E2 • Les vipères d'Agrabah

Blanche-Neige et Charmant organisent l'installation des arrivants du Monde des Histoires à raconter quand l'un des nouveaux arrivants les interpelle et leur fixe un rendez-vous secret. Regina reconnait l'homme : c'est le Comte de Monte-Cristo, un homme assoiffé de vengeance qu'elle a manipulé alors qu'elle était la Méchante Reine pour tuer le couple.

S6 E3 • Le soulier de verre

Alors que Storybrooke continuera d'accueillir de nouveaux habitants des Terres des Untold Stories, des familles, amis et même des ennemis du passé se retrouveront. Lorsque Ashley (Cendrillon) tentera de retrouver sa belle-famille avec l'intention de régler leur ancien conflit, Emma, Crochet et Henry se démèneront pour lui venir en aide avant qu'il ne soit trop tard... Parallèlement, Regina tentera de tirer des informations à Mr Hyde concernant la façon de vaincre l'Evil Queen. Snow, quant à elle, apportera son aide à Jekyll afin de lui trouver un laboratoire décent pour son travail. David, de son côté, conclura un marché avec Gold : il ira ainsi délivrer un message à Belle pour obtenir de nouvelles informations sur son père. Enfin, dans un flashback, Cinderella ira à un bal et là-bas, elle y rencontrera son Prince.

S6 E4 • Le vrai méchant

L'Evil Queen et Hyde tenteront de trouver le sérum du Dr. Jekyll dans le but de le voler. Parallèlement, Snow sera excitée à l'idée de retourner à l'école en tant qu'institutrice. Alors qu'Emma se languit de s'installer enfin avec Hook, ce dernier sera quant à lui occupé à protéger Belle de Mr Gold, qui s'est clairement assuré qu'elle ne puisse pas quitter le bateau de pirate. Dans la Forêt Enchantée, Rumple aide Dr. Jekyll à terminer la composition de son sérum qui permet de séparer la personnalité d'un homme en deux, la bonne et la mauvaise. Mais son aide exigera un prix non négligeable.

S6 E5 • Jasmine et Aladdin

Maintenant que Hyde est mort, la Méchante Reine est seule pour amener Emma vers son destin et la manipule pour la forcer à révéler ses visions à sa famille. En cherchant l'Oracle, les héros retrouvent Jasmine, toujours à la recherche d'Aladdin, autrefois Sauveur et grand ennemi de Jafar.

S6 E6 • En eaux troubles

Henry découvre que Crochet a conservé les ciseaux et veut s'en débarrasser lui-même ; ce faisant, ils découvrent un nouvel arrivant du Pays des Histoires non racontées : le Nautilus. Emma essaie de réconcilier Aladdin et Jasmine et les convaincre de chercher un moyen de sauver Agrabah.

S6 E7 • La pousse magique

La Méchante Reine révèle sa nouvelle menace contre les héros : si Blanche-Neige et David ne donnent pas volontairement le cœur qu'ils partagent, elle répandra l'eau de la Rivière des Âmes sur Storybrooke. Regina espère contrer le plan de son double en semant la zizanie entre elle et ses soutiens. La Fée bleue a peut-être un moyen d'empêcher la destruction de la ville, un arbrisseau fait d'amour véritable.

S6 E8 • Le rocher de Sisyphe

Emma et Regina fomentent un plan pour coincer la Méchante Reine dans le monde derrière les miroirs mais c'est elles qui se retrouvent emprisonnées, laissant à la Reine toute liberté de manipuler Henry et tenter d'en faire un allié. Belle demande l’aide de Zelena pour obtenir le moyen de fuir loin de Gold, et la sorcière a l'idée d'utiliser les talents de voleur d'Aladdin. Blanche-Neige et David s'adaptent difficilement à leur nouvelle condition d'amants maudits.

S6 E9 • La fée noire

Gold pousse la Méchante Reine à tuer sa sœur, Zelena, mais Regina parvient à la retenir. Belle découvre que Gold prévoit d'accélérer sa grossesse pour enlever leur bébé et cherche un moyen de protéger l’avenir de son enfant en demandant de l’aide aux fées. Jasmine trouve une lampe qui a perdu son génie, seul moyen qu'elle espérait trouver pour retourner à Agrabah.

S6 E10 • Trois vœux

Emma a mis la main sur l'épée qui doit la tuer, une arme qui pourrait vaincre la Méchante Reine sans tuer Regina. La Méchante Reine utilise donc les pouvoirs d'Aladdin, devenu le génie, pour réaliser le vœu le plus cher d'Emma : ne jamais être devenue la Sauveuse. Regina étant la même personne que la Méchante reine peut aussi faire des voeux et fait celui de rejoindre Emma. Rumplestiltskin essaie de retrouver son fils et découvre que la Fée noire l'a enlevé. Après avoir passé un marché avec Rumplestiltskin de la fausse réalité, Regina essaie par tous les moyens que Emma se souvienne de la vraie réalité. Elle a réussi et rentre avec Emma à Storybrooke à l'aide du haricot magique mais elles le ratent car Regina n'a pas voulu rentrer après avoir vu Robin des bois de la fausse réalité. La personne sous la cape de la vision d'Emma est arrivée et dévoile son identité à ses parents : Gideon, le fils de Belle et de Rumplestiltskin.

S6 E11 • L'autre Robin

Coincée dans la Forêt enchantée que la Méchante Reine a créée pour elle, Emma rate sa chance de partir à cause de Regina qui a vu Robin. Elle a cependant une idée pour partir : une armoire similaire à celle que Geppetto a construit pour elle bébé. Regina s'interroge sur ce monde où Emma n'est jamais devenue la Sauveuse et part l’explorer. À Storybrooke, Gold et Belle découvrent les ambitions de Gideon : tuer Emma pour devenir le Sauveur et vaincre la Fée noire.

S6 E12 • Le vrai meurtrier

David est sur le point de démasquer le tueur de son père et compte sur les talents de pirate de Crochet, mais le corsaire veut montrer qu'il a changé et qu'il est digne d'Emma. Regina essaie de renouer avec Robin en lui montrant la vie de l'homme qu'elle a aimé.

S6 E13 • La guerre des Ogres

Lorsque Gideon reprend sa mission pour tuer Emma et devenir le Sauveur, M. Gold intervient pour s'assurer que l'usage de la magie noire n'empoisonne pas son fils. Pendant ce temps, Robin se montre ouvert à tout allié lui offrant la possibilité de fuir Regina et Storybrooke. Crochet trouve le courage de se confesser à Emma, mais pas avant qu'elle ait découvert qu'il gardait un autre secret. Au Royaume enchanté, le légendaire héros Beowulf vise Rumplestiltskin après que le Ténébreux a utilisé ses pouvoirs pour vaincre les Ogres et remporter la guerre.

S6 E14 • La flèche de Cupidon

Pensant qu'il n'y a pas de place à Storybrooke pour elle et Regina, la Méchante Reine projette d'éliminer son autre moitié en utilisant Robin afin de l'appâter dans son piège. Crochet, déterminé à arranger les choses avec Emma, se tourne vers son vieil ami le Capitaine Nemo pour obtenir ses conseils, mais Gideon saborde ses plans avant qu'il ne puisse le faire. Au Royaume enchanté, la Méchante Reine apprend une leçon surprenante sur la véritable source de sa misère.

S6 E15 • L’exil du cœur

Lorsque Crochet se retrouve coincé dans un autre royaume avec l'équipage du Nautilus, il s'empresse de retourner auprès d'Emma avant que Gideon n'exécute le reste de son plan. À Storybrooke, Regina et Mary Margaret font sortir Emma pour lui changer les idées suite à la disparition de Crochet. À Agrabah, Jasmine devient amie avec Ariel, et toutes deux se mettent ensemble à localiser le Prince Éric alors que la menace de Jafar s'accroît.

S6 E16 • Les remords du lâche

M. Gold et Belle convainquent Emma d'aider Gideon, expliquant qu'ils peuvent ensemble arrêter la Fée Noire. Henry ressent un changement troublant dans ses pouvoirs, poussant Regina à chercher conseil auprès du précédent Auteur. Pendant ce temps, au Royaume enchanté, Crochet tente de gagner l'aide d'un vieil adversaire en pariant sa plus précieuse possession dans une partie de cartes. Dans le passé, la Fée Noire torture le jeune Gideon dans l'espoir d'en faire le parfait apprenti.

S6 E17 • L'effet d'une fleur

Toujours piégé au Pays Imaginaire, Crochet s'allie avec Lily la Tigresse, espérant trouver un moyen de retourner auprès d'Emma. À Storybrooke, Regina tente de briser le charme du Sommeil sous lequel sont David et Mary Margaret, et Gold ignore la Fée Noire, ce qui les amène dans une impasse redoutable. Dans le passé, Blanche-Neige et le Prince Charmant font un sacrifice afin qu'Emma accomplisse son destin de Sauveuse.

S6 E18 • Plus jamais seule

Dans le passé, Zelena devient amie avec un jeune bûcheron qui a été maudit et s'est tourné vers elle pour trouver un nouveau cœur. Elle est alors forcée de choisir entre garder ses pouvoirs magiques ou son amitié avec lui. À Storybrooke, Zelena décide d'affronter et d'arrêter la Fée Noire, une bonne fois pour toutes, contre le vœu de Regina. Pendant ce temps, les Charmant sont en désaccord concernant les plans de mariage d'Emma et Crochet.

S6 E19 • Le livre des prophéties

Dans le passé, après que la mère de Rumplestiltskin, Fiona, a appris que le destin de son fils a été prophétisé par sa marraine-fée, celle-ci fait tout son possible pour l'empêcher de se réaliser. Finalement, Fiona devra prendre une décision qui changera le cours de leurs deux vies à jamais. À Storybrooke, Gold fait face à un dilemme similaire.

S6 E20 • Mélodie d'amour

Dans le passé, Blanche-Neige et le Prince Charmant font un vœu spécial destiné à protéger Emma. Le résultat du souhait pousse alors tout le Royaume à chanter, ce qui rend la Méchante Reine furieuse. À Storybrooke, la Fée Noire annonce vouloir jeter une nouvelle Malédiction sur la ville, tandis que Crochet et Emma se préparent pour leur mariage.

S6 E21 • La bataille finale (1)

Henry se réveille dans une Storybrooke maudite et découvre qu'Emma a été enfermée à l'asile, tandis que la Fée Noire est devenue maire de la ville. Henry tente d'aider Emma à recouvrer la mémoire alors que Gold cherche à découvrir ce qui est réellement arrivé à Belle. Pendant ce temps, Blanche-Neige, Charmant, Regina, Zelena et Crochet sont piégés dans un Royaume enchanté au bord de la destruction, essayant de trouver un moyen de rejoindre Emma et Henry.

S6 E22 • La bataille finale (2)

Henry se réveille dans une Storybrooke maudite et découvre qu'Emma a été enfermée à l'asile, tandis que la Fée Noire est devenue maire de la ville. Henry tente d'aider Emma à recouvrer la mémoire alors que Gold cherche à découvrir ce qui est réellement arrivé à Belle. Pendant ce temps, Blanche-Neige, Charmant, Regina, Zelena et Crochet sont piégés dans un Royaume enchanté au bord de la destruction, essayant de trouver un moyen de rejoindre Emma et Henry.