Tirés de faits réels ayant eu lieu dans les années 70, le réalisateur britannique Michael Apted («Gorilles dans la brume»), envoie Ray Levoi (Val Kilmer), jeune agent du FBI rejoindre l’agent Coutelle (Sam Shépard) dans le Dakota du Sud pour enquêter sur une série d’homicides non élucidés survenus dans une réserve indienne. Arrivé sur les lieux, ce jeune agent idéaliste va être témoin d’une guerre ethnique entre les indiens conservateurs et les indiens gouvernementaux constitués en milices surarmées. Michael Apted amène son film comme un documentaire poignant dès lors que le spectateur entre dans la réserve de «Bear Creek». Devant nos yeux s’étalent des laissés pour compte vivant au milieu de carcasses de voitures dans des bidonvilles. Le contraste est saisissant avec le prologue du film à Washington. A l’instar de «Mississippi Burning» d’Alan Parker auquel «Cœur de Tonnerre» ressemble dans son montage, nous avons devant nous, deux Amériques différentes qui se confrontent. Ayant des ancêtres sioux, Ray Leroi pourrait être le lien manquant entre deux cultures. Au fur et à mesure de son investigation, au contact de ses lieux sanctifiés par les Anciens (dont le chamane Sam Reaches), Ray va se rapprocher de plus en plus de ses racines jusqu’à avoir des visions de son passé. Commence alors pour Ray un voyage initiatique en terre indienne. Dès lors, l’acharnement de ses supérieurs à vouloir arrêter l’indien Jimmy Looks Twice comme principal coupable ressemble pour Ray à un complot de bien plus grande envergure qu’une simple guerre ethnique. Michael Apted nous entraîne dans un passionnant western moderne au cœur d’une enquête policière mêlée de poussière et de sang, le sang d’un peuple martyr.