L'intégration du live action sur Code Lyoko Evolution était audacieuse, et les visuels sur Lyoko montrent une amélioration technique et moderne. Certains épisodes, comme celui des clones sur Lyoko, présentent des concepts intéressants. Le nouvel antagoniste, Tyron, et ses Ninjas apportent une certaine dimension aux combats, bien que ses motivations restent floues durant toute la saison.
Cependant, la série souffre de nombreuses incohérences avec l'œuvre originale. L'intrigue principale est faible et le manque de personnages iconiques comme Sissi est notable (présente dans un seul épisode). Les attaques de XANA sont beaucoup moins effrayantes et interrompent constamment le l'intrigue principale, rendant l'histoire répétitive et ennuyante à regarder. Les relations entre les personnages principaux sont moins profondes et manquent de chaleur. Les combats sur Lyoko sont moins spectaculaires et engageants que dans le dessin animé, et la disparition des territoires Forêt et Banquise réduit la diversité visuelle et scénaristique.